深圳ISO14001环境管理体系认证中体系文件的作用体现在：
①便于协调管理，统一行为，规范操作：由于目标明确，责权清晰，便于在体系的实施过程中协调各种关系，避免相互推托扯皮。
②便于有效实施：由于控制标准明确，步骤具体，对运行操作能够提供有力的指导，使各层次员工不仅明白自己应该做什么，而且明白怎么做，确保了环境管理的有效性。
③便于持续改进：通过不断地完善作业文件，增加、补充成熟的经验，为日常工作中环境因素的控制提供有效指导，达到预防为主的目的。同时文件对体系运行过程和结果的关键特性和重要信息都给予了标识记录和管理，能够为考核和审核提供客观有效的证据。
因此，环境管理体系文件的建立，有助于克服以往环境管理中因随意性大、部门之问责权不清、作业活动不规范而造成的管理不到位、效能不充分的缺陷。有利于达到环境管理的目标。
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